PD患者在中晚期以后，许多患者会不可避免地出现药物疗效减退、症状波动和异动症等严重并发症，部分患者通过上述药物调整也无法解决，此时，适当的外科手术将是一种好的选择。
外科手术有三种类型，第一种是毁损手术，毁损靶点为丘脑的Vim核、苍白球腹后内侧核（GPi）和丘脑底核STN；第二种手术是深部脑刺激DBS；第三种是干细胞移植。毁损手术由于其较重的不良反应，如吞咽、语言和平衡功能障碍，并且其1-2年后的远期疗效较差，目前在欧美等国家已很少尝试。神经干细胞移植目前还处于动物实验阶段，要用于临床可能还要很长时间。现阶段，DBS植入是治疗PD的最新进展，在发达国家已基本取代了毁损手术。
DBS是利用脑立体定向手术在脑内某一特殊位置植入电极?如STN等。DBS改善PD的可能机制：①DBS刺激了局部抑制性神经递质的释放；②去极化阻滞，DBS类似于在靶区功能性的毁损，提高了兴奋性电位的阈值；③调节神经元活性：DBS的脉冲式放电刺激产生了规律和稳定的放电模式?纠正了PD患者基底节环路神经元的异常兴奋和不规律放电。经过多个临床中心的研究表明，STN的DBS手术，不仅可改善PD的所有症状，包括“起步困难”、“步僵”等中线症状，而且还能减少左旋多巴的用量，对左旋多巴产生的不良反应，如异动症、痛性痉挛都有很好的疗效。
DBS可使患者在药物的“关”期ＵPDＲＳ的总分下降了42%，运动功能评分降低48%。震颤、僵直和运动迟缓有明显改善。药物的总量在术后1年减少38%，2年时减少36%。异动症的评分减少46.4%。
手术主要适用于以下患者：①典型PD，曾对左旋多巴制剂有效。②经系统药物治疗后，无法再控制症状或出现运动障碍合并症，调整药物亦无法改善。③无严重的认知和精神障碍以及严重
脑萎缩。④确诊后经过左旋多巴治疗至少5年以上，该时间的限制基于两点，一是因为PD对左旋多巴的反应良好，其“蜜月期”多在5年以上，如果患者早期就对左旋多巴反应差，其PD的诊断就值得怀疑；二是因为有部分PD叠加综合征患者，早期症状轻，对左旋多巴也有一定反应，这时如果手术，不仅没有疗效，反而可能加重病情。
